Vagrantでshared folderの権限を設定していたらローカル環境のgitが全部変更ありステータスになって！！とか焦っていたらgitはパーミッションの変更を検知するらしい・・
さてさてどーしよーかとか思っていたが、その辺は柔軟性に優れるgit！？なので、下記設定でoffれる

git config core.filemode false